短程分子蒸馏适用于分子蒸馏，使分子流从加热表面直接通向冷凝器表面是不容易的。一般情况下，液相扩散速率是决定分子蒸馏速度的主要因素，因此，应减小液层厚度，增加液层流动。

 随着温度的升高，短程分子蒸馏蒸发率增大，但分离系数有时随温度的升高而减小。所以，在热稳定性基础上，应选择经济合理的蒸馏温度。水蒸气分子在蒸发到凝结表面时会互相碰撞，并且可以与停留在两边的空气分子相碰撞。

 因为蒸发分子远比空气分子重，而且他们的大多数运动方向都是一样的，所以它们自身的碰撞对飞行方向和蒸发率影响很小。剩余分子在两面均为混沌运动，故残留分子数是影响蒸发方向和蒸发速度的主要因素。

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